本作是为了纪念在1996年起开始的《游戏王》系列漫画连载二十周年所推出的动画电影。在跨越无数的试练后，武藤游戏与身体内的另一人格“暗游戏”进行最终决战并获胜，在作出正式诀别后踏上各自的旅途。在经历一段时间后，游戏等人重新回归平凡的生活。然而，一名自称蓝神的神秘少年却出现在他们的眼前。另一方面，将暗游戏视为劲敌的海马濑人，在暗游戏消失的地方发掘“千年积木”并打算将其重新完成，试图再度复活暗游戏。
演员：小野坂昌也,青木沙耶香,吉野裕行,宫本充,小林沙苗,藤原启治,阪口大助,小林优,森田成一,广桥凉,千叶进步,太田哲治,有本钦隆,菅生隆之,中田和宏,伊藤美纪,后藤沙绪里,神田朱未,子安武人,三宅健太,山口胜平,大林隆介,若本规夫,井上麻里奈,羽多野涉,伊丸冈笃,永泽菜教,平野俊隆,古泽彻,楠大典,斋藤千和,伊藤静,神奈延年,大畑伸太郎,高垣彩阳,斧笃,长克巳,塚田正昭,速水奖,河本邦弘,浪川大辅,成田剑,小伏伸之,西村知道,杉田智和
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